Yamaha重型巡航跑车FJR1300首见于2001年，然后在04年追加ABS系统，再在06年增设不需扣扳离合器牛角的YCC-S半自动波箱版本 。其后一直到13年才有新改良。包括外型细节、引擎管理模组、供油系统、电子防护系统和避震配套。
新车也继续提供A和AS两个版本，A是有极力子牛角的传统转波版本，而AS则是没有极力子牛角的YCC-S半自动波箱版本。
自2013年起，YCC-S系统更有新改良，转波反应更快，也可选择以手指转波或以脚部转波。 也增设Stop Mode功能，低速停车后，波段可以自动回防至一波。这个stop mode功能可以取消，如果骑士经常在落斜起步的话，便无需回防一波。
YCC-T + TCS + D mode
两个版本都配备YCC-T晶控电子油门Yamaha Chip Controlled Throttle，TCS循迹系统Traction Control，Sport及Touring双重动力模式系统(Driving Mode)，以及用左手单指一按即可启动的Cruise control定速巡航系统。
为了配合YCC-T晶控电子油门的需要，节气阀和排气系统都经过重新设计。TCS循迹系统的技术来自MotoGP实战平台，运作原理是透过监测前后轮圈转速 。
经过运算及分析后，在有需要时调整点火时间、供油量和电子油门来改变动力输出。死气喉配备双重催化器和氧气senor，提升燃烧效率及废气质素。
水冷直四，双平衡轴，轴传动
2013 FJR1300的动力心脏仍是一台1298cc四衝程水冷并列四汽缸引擎。引擎以前倾式放置在Deltabox铝合金车架之内，成为车架结构的一部件，以减轻车架的重量。
前倾式放置的目的是降低引擎重心。引擎规格是以DOHC双凸轮轴驱动每汽缸四气阀，内置双平衡轴以减低引擎震动，传动模式仍是保养简单的轴传动。
新车的缸径、衝程和压缩比都维持不变，但汽缸壁有新改良，提升散热能力。马力和扭力都有很轻微的增加，详情请看页底规格表。
Unified Braking System + Cruise control
新车的头叉的叉芯设计和尾避震弹簧都有新改动，吸震更强，提升骑士乘客的舒适性。尾摇臂长度也有所增加，提升车辆操控性。
新车的头风挡导流功能也经过重新设计，风档在表板底部和两侧都有导风口，让骑士按照天气调整送风量。
除此之外，表板也是全新设计、分为左中右三区，让行车资料一目瞭然。以大灯行车，左右双灯齐亮，更有LED日间行车灯，连指挥灯也是LED灯设定。
骑士座位有两段式座高调整，转向把手也可作三段式位置调整，可调较高度和角度的电控风挡，每次熄车和著车都会维持最后的位置。
以左手单指一按即可启动的Cruise control定速巡航系统，启动时当迫力、离合器或油门有任何动作的话便会自动取消定速巡航功能。系统并有一按回复的resume功能，让系统自动返回上次的设定。转向把手上制盒的按钮，有发热手柄、电风挡、表板显示选择、D-Mode和TCS功能选择和头灯角度调较。
令人再度鼓掌是新车採用联合煞车系统Unified Braking system，并有ABS防抱死功能。头制动卡钳配备八个活塞，当扣动右手迫力牛角，会启动其中六个制动卡钳。踩下尾制动脚踏，会启动剩下的两个头轮制动活塞和尾轮的两个制动卡钳。
新车的尾扶手和三箱式尾箱接口位，都是直接安装在副车架之上。三箱全用一条车匙开启。车头有12V供电插座，让GPS和电话可以充电。骑士和乘客的座垫物料密度不同，骑士的坐垫密度较高，操控性较强，乘客的密度较低，坐得较舒服。乘客座位下收纳了工具包。
Yamaha FJR 1300A / AS 规格表
引擎形式 四衝水冷前倾式并列四汽缸
DOHC 16气阀
缸径 x 衝程 79.0mm x 66.2mm
压缩比 10.8:1
总排气量 1,298cc
燃油供应 电子燃油喷注系统
传统系统 湿式多片离合器，五前速轴传动
最高马力 146.2hp / 8,000rpm
最大扭力 14.1kg-m/7,000rpm
车架形式 Deltabox铝合金车架
前倾角( R) 26度
拖曳距(T) 109mm
前悬挂系统 48mm套管前叉 ，135mm行程
后悬挂系统 连杆式单筒油压避震，125mm行程
轮胎(前) 120/70 ZR17 M/C(58W)
轮胎(后) 180/55 ZR17 M/C(73W)
前掣动系统 320mm双碟UBS八活塞对向卡钳
后掣动系统 282mm煞车碟UBS单活塞卡钳
全长 2230mm
全阔 750mm
全高 1325 / 1455mm
离地距 125mm
轴距 1545mm
座高 805 / 825mm
装备重量 296kg
油缸容量 25公升
